跨链智能合约是指能够在不同区块链之间进行互操作的智能合约，也就是说，它们可以跨多个区块链执行。这样的智能合约让不同区块链上的资产或数据得以交换或交互，而无需中心化中介。例如，用户可以在以太坊上执行的一个智能合约中，触发比特币网络上的交易，从而实现两种不同区块链资产的交换。

跨链智能合约面临的主要挑战包括：

1. 安全性：由于涉及到多个区块链的交互，一旦某个链的安全性受到威胁，这种威胁可能会传导到通证其他链上，增加系统性的风险。因此，设计安全的跨链协议是实现跨链智能合约的一大难题。

2. 互操作性：不同的区块链可能有不同的技术栈、通信协议、数据格式等，如何在这些异构系统之间建立有效的通信与交互机制，是一大挑战。例如，以太坊支持智能合约，而比特币则不直接支持，这要求有特定的技术如侧链或中继链来解决这一问题。

3. 性能：跨链操作通常比单链操作复杂得多，包含更多的网络通信、状态同步等步骤，这可能会导致性能上的瓶颈，尤其是在大规模应用时。

4. 法律与合规：在不同的司法管辖区，区块链技术及其应用的法律地位可能不同，这可能会影响跨链操作的合法性及其合规性。此外，如何确保跨链交易符合不同地区的监管要求也是一个挑战。

5. 标准与协议：虽然有一些标准化的努力，比如W3C的分布式账本技术工作组等，但目前尚缺乏广泛接受的跨链标准与协议。不同项目的协议互不兼容，增加了跨链操作的难度。

为了应对这些挑战，有许多研究与实践正在进行中，比如Cosmos网络提出了Hub-and-Zone模型来实现不同区块链之间的互操作，以及Polkadot提出的中继链方案允许不同区块链通过平行链的形式连接，支持跨链通信。这些创新和探索正在逐步推动跨链技术的发展。