1. 面试官：请解释RNA测序技术中的single-end测序和paired-end测序有何不同？

2. 面试官：介绍一下RNA测序中的strand-specific测序是如何实现的？

3. 面试官：如何选择合适的测序深度（coverage）来进行RNA测序实验？

4. 面试官：请概述RNA测序中的de novo组装和参考基因组比对的优缺点。

5. 面试官：解释一下在RNA测序中遇到的reads去除（read trimming）过程以及其重要性。

6. 面试官：如何对RNA测序数据进行差异表达基因分析？请列举常用的方法和工具。

7. 面试官：RNA测序中的融合基因检测是指什么？说明其在肿瘤学研究中的作用。

8. 面试官：解释RNA测序中的isoform分析是如何进行的？

9. 面试官：RNA测序中的全转录组测序（total RNA sequencing）有何特点和应用？

10. 面试官：介绍一下RNA测序中常见的数据解析挑战及应对策略。