1. 面试官：请解释什么是蛋白质互作网络及其在生物学研究中的重要性。

2. 面试官：如何利用蛋白质质谱数据进行蛋白质互作网络分析？请详细描述分析步骤。

3. 面试官：谈谈您对蛋白质互作网络中蛋白质节点中心性指标的理解及其在网络分析中的作用。

4. 面试官：针对大规模蛋白质互作网络，如何判断蛋白质互作的可靠性？请介绍相关的验证方法。

5. 面试官：请解释蛋白质互作网络中的HUB蛋白质，并说明其在网络拓扑结构中的重要性。

6. 面试官：如何利用网络模块化方法对蛋白质互作网络进行功能模块的发现和分析？请举例说明。

7. 面试官：谈谈您对蛋白质互作网络中的社区结构的认识，以及发现蛋白质互作网络中的功能模块的策略。

8. 面试官：如何利用机器学习方法来预测蛋白质互作网络中的潜在蛋白质互作关系？请说明预测模型的构建步骤。

9. 面试官：探讨蛋白质互作网络中的跨物种互作关系的研究意义及挑战。

10. 面试官：针对蛋白质互作网络中的蛋白质功能预测，如何结合多种生物信息学数据进行综合分析？