构建可再生能源知识产权保护的合同条款，确保降低公司发生法律纠纷的风险，需要细致考虑若干关键条款的设计。以下是一些具体的建议及其示例条款，适用于合同中的知识产权保护部分：

1. 定义范围明确 首先，合同需要明确定义哪些知识产权将受到保护。这包括但不限于专利、商标、版权和技术秘密等。例如： “双方同意，本合同项下的知识产权涵盖但不限于甲方提供的所有专有技术、产品设计、软件代码及相关文档。其中，专利权包括已申请和未申请的发明、实用新型和外观设计专利。”

2. 权利归属 合同应明确指出，在项目开发过程中产生的知识产权归属问题。例如，如果项目成果是在特定条件下由双方合作完成的，需要事先确定权利归属。示例条款： “本合同有效期内，甲乙双方合作开发的技术成果，其知识产权归双方共同所有。未经另一方书面同意，任何一方不得单独使用或许可第三方使用。”

3. 使用权限 设立条款，规定哪方或哪几方拥有使用协议中提到的知识产权的权利，以及使用的具体条件。如使用范围、期限和是否可以许可给第三方等。示例： “甲方授予乙方非独占、不可转让的许可，允许乙方在本合同框架内使用甲方的知识产权。本许可有效期自合同生效之日起计算，为期5年。期间届满后，未经甲方同意，乙方不得继续使用。”

4. 保护义务 包含双方在保护对方知识产权方面的承诺。例如，确保信息的保密性、不侵犯第三方知识产权等。示例条款： “双方同意采取一切必要措施，保护本合同项下的知识产权不受侵犯。任何一方泄露商业秘密或未授权使用知识产权的行为，均视为违反合同约定。”

5. 侵权责任 约定如果一方因使用知识产权而侵犯了第三方权利时的责任分配。例如，谁将承担法律责任，哪些费用需要承担等。示例： “因乙方在执行本合同过程中侵犯了第三方知识产权，导致甲方遭受损失的，乙方应负责赔偿甲方由此产生的一切损失，包括但不限于诉讼费、律师费、赔偿金等。”

6. 争议解决机制 建立有效的争议解决机制，以防未来发生纠纷时有明确的法律途径可以遵循。这可以是通过仲裁解决，也可以通过法院诉讼，或者特定国家/地区的司法程序。例如： “对于因执行本合同而产生的任何争议，双方首先应尝试通过友好协商解决。如果协商不成，则任何一方均可将争议提交至甲方所在地的仲裁委员会，按照提起仲裁时该会现行有效的仲裁规则进行仲裁。”

通过上述条款的设计，可以在很大程度上为公司提供知识产权方面的法律保护，减少因知识产权争议引发的法律风险。